航空自衛(wèi)隊(duì)新人甘粕檜曾根因性格率直屢次傷人而身心疲憊，選擇以任期制自衛(wèi)官身份在岐阜基地服役。某日被秘密隱藏于基地的外星生命體“瑪索丹”選中，成為可變形為戰(zhàn)斗機(jī)的OTF（變態(tài)飛翔生命體）操縱者。隨著與瑪索丹建立共生關(guān)系，檜曾根逐漸理解這個(gè)被日本政府收容的外星生命體實(shí)為維護(hù)國家空防的關(guān)鍵戰(zhàn)力——其存在本身既構(gòu)成潛在威脅，又是對(duì)抗其他失控OTF及外星入侵的核心屏障。在接連應(yīng)對(duì)異形生物襲擊、國際外交危機(jī)等事件中，她與隊(duì)友們發(fā)現(xiàn)瑪索丹族群與人類存有古老淵源，而自衛(wèi)隊(duì)高層隱瞞的“星之子計(jì)劃”真相將最終決定人與OTF能否共存的命運(yùn)走向。