逃犯馬克攜贓款劫持飛機試圖逃離美國，卻在與警方對峙中導致客機迫降于墨西哥偏遠沼澤區。除他之外的幸存者包括空姐艾米、地質學家大衛及受傷的聯邦探員，他們在尋找救援途中遭遇體型超過十米的史前鱷魚襲擊。這支遠古鱷魚群因當地非法鉆探工程暴露于地底，其首領個體在吞噬腐爛石油污染物后發生變異，展現出極強攻擊性與領地意識。團隊被迫分頭行動時，馬克利用鱷魚對振動的敏感特性，在廢棄鉆井平臺引爆炸藥與巨獸同歸于盡，艾米和大衛最終乘直升機逃離燃燒的沼澤。