電影《琉璃庭院》講述的是，文根英飾演的生物工程研究生李在妍致力于研究一種能產生葉綠體的血細胞，準備將該課題在學術大會上發表。鄭教授作為這一研究小組組長，覺得這個課題的研究難度太大、周期太長，很難在學術大會上通過來募集研究經費。于是他聯合另一位女研究生崔秀姬，竊取了李在妍的實驗樣本，將提取的抗老化物質用于開發新型化妝品。遭遇到被自己愛慕的教授的背叛后，李在妍選擇遠離人群，回到小時候自己待過的琉璃庭院繼續她的研究。鄭教授因之前的實驗樣本被污染，回來找李在妍重新制作，被李在妍拒絕后不慎跌入死水溝里斃命。李在妍發現后，便用鄭教授來進行人體實驗，希望他可以像被她醫治的樹一樣被救活…… 看這樣一部電影可以讓人回憶起很多事。 1、女主角文根英 她在2000年的電視劇《藍色生死戀》首次亮相熒幕，在劇中飾演童年恩熙。那時候的互聯網還沒有像現在這么普及，人們看電視還是通過電視臺直播。在中韓建交十周年之際，內地大量引進韓劇，而《藍色生死戀》儼然成為了同期影視作品中的代表作。在我的中學時代，關于《藍色生死戀》的討論不絕于耳，以至現在，我猶記得同桌對文根英的狂熱。

后來，又看過文根英的一部電影《薔花，紅蓮》，那是一部關于家庭倫理的懸疑驚悚片。本片《琉璃庭院》的劇情和主題與之完全不同，但透露出的那種憂傷卻很相似。

2、三段式電影《三更》中的第一段故事《回家》 黎明飾演的于輝將妻子的尸體藏在家中，天天用中藥泡澡，希望她醒過來。在外人看來，這絕對是一個心理變態，但是是什么信念支撐著他這樣熬過了三年？隨著劇情的推進，我們才知道，原來當初于輝自己就是靠妻子用同樣的方法苦苦熬了三年被救活的。當我們滿懷期待地想要看到于輝能成功救活妻子時，不明真相的鄰居和警察，如同一開始不明真相的我們，打斷了這個醫治過程，就像83版《射雕英雄傳》里黃藥師在救妻子馮氏的關鍵時刻被歐陽鋒闖入打斷一樣無比遺憾。

在《琉璃庭院》的尾聲部分，該事件被小說家作為小說發表，因為被出版社在封面標注了“實錄”二字，引起了警方的調查。李在妍只得放棄鄭教授，只身在樹林里躲藏起來。 一切就只差那么一點點…… 3、微微著的一本微型小說集《毛骨悚然的愛》的第一篇故事《人樹》

《琉璃庭院》里，中年喪妻的鄭教授與女學生們關系曖昧，后來又背叛李在妍，對李在妍的傷害是極大的。李在妍母親因難產而死，李在妍出生時左腳先天畸形，12歲時停止生長，導致走路一瘸一拐。這些都被身為伐木工的父親認定為樹林的詛咒。鄭教授來到李在妍學校進行講座時，在校園路上與李在妍相識，由于步幅相同，令李在妍萌生愛意。之后在研究所他們也有合影，只是最后李在妍才感悟到“他給我露出的笑容其實并不是對著我，知道得太晚了。”這句話的意思是，雖然是合影的照片，我們拿在手里看會感受到照片里的人在對我們微笑，但是其實拍照時對著的是相機，并不是彼此，所以只是我們自己主觀上的一廂情愿，這句話實在太有哲理了。

受到鄭教授的背叛后，原本李在妍選擇了逃避。可是因緣際會，樹林以另一種方式讓鄭教授留在了李在妍的身邊。面對大自然的這樣一份厚禮，李在妍便卻之不恭了。之后，鄭教授便如同一盤植物一般，被李在妍精心照料著。

其實本片還有一條主線，就是小說家金志勛。一開場，金志勛就遭女友拋棄，又因醉酒時對大作家動粗被文學界封殺。走投無路的他，搬進了李在妍之前的租房里，看到了墻壁里李在妍留下的筆記后，一路找到李在妍的琉璃庭院。他對李在妍的身世和研究非常感興趣，于是以她為藍本寫了一部“樹女”的小說。小說中描寫她出生在一棵枯樹的樹根里，樹干是她的骨骼，白色的纖維是她的身體，身體里流淌著綠色的血液。她將耳朵貼在樹干上聽，就能聽到樹林里所有的故事。后來她成長為一個女人，離開樹林來到了城市，但是綠色的血管令她在夏日里也只能穿著長袖遮掩。她向人們念叨著她知道如何將人變成樹的方法，人們只是微笑，沒有人理解…… 小說家金志勛患有先天腦動脈狹窄，身體神經開始逐漸變硬難以控制。他的狀況就像是小說里人逐漸變成樹的樣子。正因為本片中穿插著小說家的獨白，使得李在妍的故事融合了現實與想象，以至結局中，李在妍“真的”變成了一棵樹。我想，這一段如此科幻的結局，也只是小說家金志勛和我們共同的美好幻想。現實的李在妍，為了逃避警方的追捕，一直躲在樹林里，最終的結局恐怕令人惋惜……