戰(zhàn)國時代和幕府統(tǒng)治結(jié)束后，日本忍者組織因戰(zhàn)敗被迫解散并從歷史中隱匿。但實際上超過20萬忍者仍暗藏于社會各處，遵循"根絕計劃"以普通身份生存。甲賀流末裔云隱九郎（坂泰斗配音）表面是足不出戶的廢柴宅男，實則繼承了超凡忍術(shù)。某日冒充快遞員的上級突然造訪，命令他潛入培育未來政要的私立忍校與宿敵伊賀一族后裔展開對抗。隨著任務(wù)推進，云隱發(fā)現(xiàn)這并非單純的情報戰(zhàn)——敵我雙方都卷入了某個試圖顛覆現(xiàn)代日本的巨大陰謀，而他體內(nèi)封印的古代忍者之力也逐漸覺醒。這場看似普通的校園潛伏行動，實則是揭開整個忍者世界存亡危機的導(dǎo)火索。原作改編自花澤健吾的同名漫畫，通過黑色幽默展現(xiàn)現(xiàn)代隱匿社會與傳統(tǒng)忍者文化的荒誕碰撞。