從小在森林長大的主人公阿嗚回歸城市后難以適應(yīng)新環(huán)境，兩位掌握超能力的老朋友浣影和藍(lán)方包突然現(xiàn)身。他們賦予阿嗚守護(hù)者使命——對抗由天才老鼠博士操控的巨型怪獸軍團(tuán)。這些怪獸通過掠奪城市資源制造混亂，其根源來自博士因?qū)嶒炇沂鹿蕦?dǎo)致基因異變的復(fù)仇計劃。阿嗚通過獸魂變身器與鎧獸基因液獲得變身能力，在數(shù)次激戰(zhàn)中逐步掌握操控風(fēng)元素的力量。隨著與怪獸軍團(tuán)的首領(lǐng)級生物"鋼齒巨像"展開最終決戰(zhàn)，阿嗚不僅成功守護(hù)能源核心，更在戰(zhàn)斗中領(lǐng)悟了城市與自然共生的真諦。歷經(jīng)考驗后，他既保留著森林賦予的生命力，又建立起與城市居民的情感紐帶，最終在雙子塔樓頂端完成首次完整形態(tài)的鎧獸合體，確立了作為新時代守護(hù)者的身份。