宇宙世紀0071年，Side3穆佐自治共和國議長吉翁·茲姆·戴昆遇刺身亡后，其子卡斯巴爾與妹妹阿爾黛西亞在父親側近金巴·拉爾護送下逃離殖民地。為躲避追捕，兄妹二人在地球改名換姓化名為愛德華·馬斯與塞拉·馬斯生活。與此同時，Side3正式更名為吉翁自治共和國，由原副議長德金·索多·扎比為首的扎比家族掌握實權。為實現(xiàn)獨立建國的野心，扎比家一面持續(xù)搜捕戴昆遺孤以消除政治威脅，一面暗中啟動新型兵器機動戰(zhàn)士的研發(fā)計劃，并與地球聯(lián)邦軍形成軍事對峙態(tài)勢?？ㄋ拱蜖栐诹魍銎陂g目睹妹妹阿爾黛西亞因接觸新人類理論而引發(fā)的精神異變，兄妹間的羈絆與吉翁政權的陰影在此過程中持續(xù)交織。