故事以人類文明衰退后的未來為舞臺，人類因不明原因陷入出生率持續低迷的困境，百年后人口銳減至無法維持文明存續的狀態。平均身高僅十公分、擁有三頭身的高智慧生物妖精取代人類成為地球主導物種，它們對糖果點心表現出特殊嗜好。最后一屆高校畢業生（中原麻衣配音）繼承祖父遺志，在故鄉樟樹之里擔任人類與妖精的調停官，卻因雙方缺乏接觸而長期處于無事可作的狀態。她轉而著手研究妖精生態，通過制作甜點建立交流媒介，逐步記錄下妖精社會的特殊行為模式。隨著人類聚落持續縮小，調停官見證著文明遺跡逐漸被自然吞噬的過程，在與妖精群體有限的互動中探尋衰退時代的意義，最終目睹妖精開始占據人類廢棄設施并形成獨特文化的現象。