在某個(gè)時(shí)間點(diǎn)的日本，突然出現(xiàn)了文學(xué)書全部被染黑的怪異現(xiàn)象。這是由書中帶著負(fù)面情緒誕生的“侵蝕者”所導(dǎo)致的災(zāi)難。被侵蝕的文學(xué)書，會(huì)逐漸地從人們記憶中消失，最后變得像是從一開始便不曾存在過一樣。于是，有特殊能力的“煉金術(shù)師”作為特務(wù)司書被派遣至圖書館，為了對(duì)抗破壞書中世界的“侵蝕者”、為了守護(hù)文學(xué)，與轉(zhuǎn)世的文豪們一起戰(zhàn)斗。