“柱”作為神秘外星生命體突現地球，以壓倒性力量威脅全人類文明。奧丁以北歐神明身份介入，在人類瀕臨滅絕之際授予特殊作戰力量——由女武神操控的英靈機甲。數年后的近未來，全球戰場形成以女性駕駛員為主、男性支援官協同的立體防御體系。日本戰區駐守著三位個性鮮明的女武神：背負生前罪孽卻實力出眾的日輪、擁有壓倒性戰術素養的機械天才月光、以狂氣姿態駕馭英靈機的破軍星。因歐洲戰線異變被調任至富士基地的精英飛行員佐伯，意外發現三位少女與其英靈機間存在靈魂共鳴現象。隨著富士山口巨型柱體持續釋放侵蝕性能量，奧丁通過全球通訊網警示諸神黃昏已進入倒計時，暗示這場跨維度戰爭實為重啟世界樹的關鍵環節。