史努比和它的朋友們乘船駛入神秘的百慕大三角洲，遭遇一連串詭異現象：桅桿無風自動、羅盤瘋狂旋轉。當幽靈船突然從濃霧中浮現時，這群冒險者目睹了骷髏水手操控大炮的駭人場景，并在躲避炮轟時意外登船。隨著調查深入，他們發現幽靈船每次現身都伴隨著海盜寶藏的離奇失蹤。在被困于鬼魅密室的關鍵時刻，史努比意外觸發機關揭開了幽靈船的秘密——所謂骷髏水手實為偽裝的犯罪團伙，利用全息投影和聲效制造超自然假象。最終眾人設下陷阱，在幽靈船再次作案時配合海岸警衛隊實施抓捕，揭穿了這起以高科技手段擾亂航運的犯罪陰謀。