地球上的人類因冥王星飛來的巨大隕石Tanatos面臨存亡危機,國際太陽系開發(fā)機構(gòu)ISDA啟動秘密計劃"D計劃"。該計劃以在小笠原近海深海區(qū)域發(fā)現(xiàn)的高智能生命體"龍"為原型,試圖開發(fā)能直接摧毀隕石的生態(tài)兵器。被送往ISDA培育的龍卵承載著人類最后希望,而此時因事故痛失家人的孤獨少年與神秘少女偶然相遇。少女的真實身份與龍存在未知關(guān)聯(lián),兩人圍繞ISDA展開行動,并在對抗Tanatos的過程中逐漸揭示生命體與人類共存的可能性。隨著龍的覺醒,其超越預(yù)期的力量開始影響戰(zhàn)局走向。