故事發(fā)生在近未來的日本，反對現(xiàn)行體制的民眾聚集在東京臨海區(qū)域建立名為"桃源鄉(xiāng)"的聚居地，建智鐵也便是其中一員。某日巨型妖怪雷獸突襲東京灣，該生物由神秘組織城護眾以秘術制造。為維護秩序，國際維和機構ASY緊急出動人型兵器鋼仙迎戰(zhàn)。經(jīng)過激烈交鋒，雷獸雖被消滅，但戰(zhàn)斗波及避難船隊造成混亂。此時神秘空中少女現(xiàn)身攻擊鋼仙，在短暫交戰(zhàn)后消失無蹤，只留下困惑的鐵也。次日清晨，漂流至岸邊的小木船上出現(xiàn)另一名少女，自稱樓蘭卻喪失記憶。隨著雙子少女的接連登場，鋼仙部隊與城護眾之間暗藏的秘術兵器研發(fā)真相、樓蘭身份之謎，以及牽動世界存亡的能量核心爭奪戰(zhàn)逐漸浮出水面。