學園都市是擁有230萬人口的特殊區(qū)域,其中八成居民為學生。作為以超能力開發(fā)為核心的科技先進地區(qū),這里聚集了眾多特殊能力者。等級5超能力者御坂美琴因自身強大的電磁能力與正直個性,屢次卷入學園都市內(nèi)發(fā)生的重大事件。在接連遭遇"樹狀圖設計者"爭奪戰(zhàn)、學園都市內(nèi)部陰謀以及外部勢力滲透等危機時,美琴始終與上條當麻、白井黑子等人共同對抗威脅。面對"絕對能力進化計劃"引發(fā)的倫理困境,她堅持守護同伴與普通學生的安全。隨著科學與能力開發(fā)體系背后的真相逐漸揭露,美琴在接連事件中不斷成長,并開始直面學園都市體制本身存在的根本性矛盾。