學(xué)園都市是擁有230萬(wàn)人口的特殊區(qū)域，其中八成居民為學(xué)生。作為以超能力開(kāi)發(fā)為核心的科技先進(jìn)地區(qū)，這里聚集了眾多特殊能力者。等級(jí)5超能力者御坂美琴因自身強(qiáng)大的電磁能力與正直個(gè)性，屢次卷入學(xué)園都市內(nèi)發(fā)生的重大事件。在接連遭遇"樹(shù)狀圖設(shè)計(jì)者"爭(zhēng)奪戰(zhàn)、學(xué)園都市內(nèi)部陰謀以及外部勢(shì)力滲透等危機(jī)時(shí)，美琴始終與上條當(dāng)麻、白井黑子等人共同對(duì)抗威脅。面對(duì)"絕對(duì)能力進(jìn)化計(jì)劃"引發(fā)的倫理困境，她堅(jiān)持守護(hù)同伴與普通學(xué)生的安全。隨著科學(xué)與能力開(kāi)發(fā)體系背后的真相逐漸揭露，美琴在接連事件中不斷成長(zhǎng)，并開(kāi)始直面學(xué)園都市體制本身存在的根本性矛盾。