該劇講述神秘外科醫生Dr.Chocolate的雙面人生。這位被稱作"醫療界班克斯"的天才以每臺手術1億日元現金、保密協議和贈送巧克力為行醫條件，實則是年僅十歲的天才少女野田干。她與前外科醫生池島友也及五位性格迥異的醫療專家組成"巧克力公司"，在各類極端環境下完成高難度手術。團隊成員包括擅長麻醉的原醫生、精通機械的天才少女，以及各具專長卻性格難搞的醫療精英。他們既要克服直升機迫降、電梯故障等突發狀況搶救患者，又在救治過程中逐步拼湊出導致野田父母遇害的跨國醫療陰謀。追蹤神秘醫生真相的女記者早乙女綾乃逐漸逼近核心，而團隊內部關于秘密手術倫理性的矛盾也日益顯現。隨著調查深入，野田發現父母死亡與某制藥公司的非法人體實驗存在關聯。