《天才麻將少女全國篇》延續動畫第一季劇情，聚焦清澄高中女子麻將部在全國大賽中的征程。故事圍繞宮永咲與原村和兩位天才少女展開：咲以"正負零分"的特殊打法聞名，卻在與全國中學生賽冠軍和的對決中獲勝，并被對方指出"并不熱愛麻將"。這番話激發咲的好勝心，促使她為追趕身為職業雀士的姐姐宮永照而加入麻將部。全國大賽期間，清澄高中先后遭遇姬松高中、永水女子高中與宮守高中的強勁對手，三位主力選手通過默契配合突破重重考驗。動畫第一季集中展現全國賽下半區二回戰的激烈對決，而原作漫畫已推進至三回戰階段。作品通過精密的心理博弈與團隊協作，呈現少女們以獨特打法挑戰頂尖麻將競技的成長歷程。