在日本市中心，一名性格孤僻的電腦工程師因非凡的技術天賦被一群偽裝成科研人員的秘密組織成員盯上。這群以同性戀身份作為掩護的極端分子，企圖利用其開發的神經接口程序操控人類意識。主角在公寓中發現可疑腳印后開始暗中調查，意外截獲對方加密通訊信號并破解出“人類凈化計劃”全息影像。隨著追查深入，他發現組織成員竟是政府資助實驗室的高官，并在對方布置的電磁陷阱中險遭腦波同化。最終他反向入侵實驗室核心系統，將組織罪證直播至全網后失蹤，警方在次日清晨封鎖現場時僅找到燒毀的服務器殘骸。