派系制度瓦解后，老四（提奧·詹姆斯飾）的母親伊芙琳（娜奧米·沃茨飾）以鐵腕手段統治墻內世界，禁止居民突破界限。翠絲（謝琳·伍德蕾飾）與老四作為分歧者決定反抗，帶領克里斯蒂娜（佐伊·克拉維茲飾）、皮特（邁爾斯·特勒飾）和托里（李美琪飾）等人突破高墻，抵達基因局。該機構表面以修復人類基因為名收留他們，實則由杰夫·丹尼爾斯飾演的大衛主導秘密計劃——通過基因改造消除分歧者并控制人類社會。翠絲團隊發現大衛與伊芙琳存在隱秘關聯，其手段與墻內統治本質同源。最終眾人聯合內部科學家揭露真相，在破壞基因局核心設施時引發致命對抗，以巨大犧牲為代價終結了雙重壓迫體系。