“百武裝展開(kāi)！！”“HUNDRED”──那是能對(duì)抗襲擊地球的神祕(mì)生物“蠻族”（Savage）的唯一武器。主角如月隼人為了成為能夠駕馭HUNDRED的武藝者（Slayer），進(jìn)入海上學(xué)園都市艦“LittleGarden”就讀。然而──“我好想你喔，隼人!!”“你、你到底是……？”對(duì)於似乎很了解自己的室友艾米爾?克勞福德，隼人產(chǎn)生了某種懷念的異樣感受。不僅如此，才一入學(xué)，學(xué)園最強(qiáng)的武藝者“女王”克蕾亞?哈維便向他提出決斗要求……!? 隼人入學(xué)前曾因意外導(dǎo)致能力被封印，而艾米爾的真實(shí)身份實(shí)為克蕾亞的專(zhuān)屬HUNDRED武裝。隨著兩人共同解開(kāi)隼人過(guò)往之謎，他們開(kāi)始協(xié)力對(duì)抗Savage襲擊與學(xué)園內(nèi)部勢(shì)力。作為關(guān)鍵戰(zhàn)力的HUNDRED系統(tǒng)、克蕾亞對(duì)隼人的復(fù)雜態(tài)度，以及隱藏在學(xué)園艦背后的全球防衛(wèi)計(jì)劃真相，均成為貫穿主線的核心矛盾。