故事圍繞性格迥異的兩名男高中生展開。患有先天性心臟病的芹澤直輝與因家庭暴力封閉自我的佐伯光太在校園相遇，兩人通過音樂逐漸靠近彼此，在櫻花紛飛的天臺確認心意。面對校園暴力、家庭阻撓與疾病威脅，他們在廢棄倉庫秘密搭建屬于二人的"天空之箱"。直輝因心臟病發作被強制轉學，光太為守護約定堅持留在原校。畢業前夕兩人重返秘密基地時遭遇暴雨，意外墜樓事故導致直輝重傷昏迷。十年后成為音樂人的光太在演唱會上彈奏兩人約定的曲目，終于完成對逝去愛人的生命告別。