倒霉特工貝肯熊為重獲特工聯盟認可，私自潛入人類秘密火星探測計劃。意外墜入火星地表下的奇異生態圈后，他發現所謂"危險外星生物"實為具有高等智慧的本土生命體。在追逐目標的過程中，貝肯熊意外解救了被困于實驗艙的火星生物首領之子，并因此獲得對方信任。當特工組織啟動代號"凈化者"的滅絕計劃時，貝肯熊被迫在摧毀外星文明以完成任務與守護新建立的跨物種友誼間抉擇。通過破解火星生物遺留科技，他最終揭露了特工聯盟掩蓋的星際接觸真相，在阻止母星武器系統啟動的同時，為兩個種族打開了和平對話的可能性。