真壁一騎是個(gè)生長(zhǎng)在對(duì)日本而言十分鄉(xiāng)下的龍宮島上的少年──對(duì)他來(lái)說(shuō)，像這樣的和平是普通到不能在普通的狀況。但當(dāng)由硅所構(gòu)成的不明生物·異界體（Festum）開(kāi)始攻擊龍宮島時(shí)，他才開(kāi)始注意到他現(xiàn)在所擁有的和平生活不過(guò)只是個(gè)被創(chuàng)造出來(lái)的假象。逐漸發(fā)現(xiàn)龍宮島實(shí)為隱藏著對(duì)抗異界體要塞的真相后，為了取回被剝奪的生活，他與同伴們駕駛?cè)祟?lèi)研發(fā)的巨大兵器·法夫那（Fafner）投入戰(zhàn)斗。在與能讀取人類(lèi)思維的敵人持續(xù)對(duì)抗中，駕駛員們逐漸面臨被硅生命同化的致命威脅。一騎為阻止弟弟紅音因駕駛法芙娜而加速同化，最終與異界體核心融合，在終結(jié)戰(zhàn)爭(zhēng)的同時(shí)完成了對(duì)和平本質(zhì)的救贖。