電影《巴斯克維爾的獵犬夏洛克劇場版》承接電視劇版故事脈絡，講述偵探獅子雄與助手若宮再度搭檔后接手的首個委托案件。日本知名資本家三好清海為調查女兒綁架未遂案的真相而雇傭若宮，卻在委托后意外暴斃并留下巨額遺產。兩人循線索前往瀨戶內海的孤島展開調查，發現當地流傳著關于魔犬噬人傳說。隨著資本家死亡真相與綁架事件的關聯逐漸浮出水面，島上顯赫家族錯綜復雜的利益關系、塵封多年的恩怨糾葛與接連發生的離奇命案形成連鎖反應。在孤立無援的環境中，若宮因關鍵證據缺失陷入絕境之際，獅子雄通過縝密推理揭開了魔犬傳說與資本家之死的雙重謎團——三好清海實為被卷入家族遺產爭奪陰謀而遭滅口，所謂超自然現象系人為制造的恐嚇手段。最終兩人通過破解百年詛咒背后的科學邏輯，將幕后黑手繩之以法，同時修復了搭檔間的信任裂痕。