新重生的博士與Rose Tyler開啟時空冒險，在阻止Sycorax族利用血液入侵地球后，他們發現倫敦某醫院聚集著貓臉修女等異星生命。穿越到平行世界時，Rose遇見已故父親Pete Tyler與另一個博士的克隆體，卻遭遇Daleks族和Cybermen族為爭奪宇宙統治權引發的星際戰爭。神秘機構火炬木小組持續監控博士行蹤，其負責人Yvonne Hartman更操控著平行世界的裂縫能量。當博士為阻止宇宙崩潰不得不將Rose困在安全時空時，火炬木遺留的TARDIS鑰匙成為兩人分離的關鍵信物。本季以博士獨自駕駛藍盒子遠去，留下Rose與平行世界的博士共同守護地球作為終章。