故事發生在未來時代，由于宇宙戰亂不斷，大批外星人紛紛到地球避難。黑衣警探作為專門處理外星事務的特殊組織，負責監視在地球生活的外星人活動。MIB成員K和J調查未登記的外星訪客時，發現銀河恐怖分子正密謀刺殺另一星球大使，這一行動可能引發宇宙戰爭并導致地球毀滅。這對黑白搭檔在追查過程中遭遇形形色色的外星人，雖然鬧出諸多笑料，但最終成功挫敗刺殺陰謀。該動畫改編自1997年全球票房破億的科幻電影《黑衣人》，后者由巴里·索南菲爾德執導，改編自威爾·坎寧漢的漫畫。影片經斯皮爾伯格監制、威爾·史密斯與湯米·李·瓊斯的演繹，成為兼具娛樂性與影響力的科幻經典。