九歲的瑪麗因父母死于霍亂成為孤兒，從印度輾轉來到英國約克郡的舅舅莊園。性格孤僻的莊園主人阿齊博爾德將自己封閉在西翼套房，禁止外人進入。嚴厲的管家梅多拉對瑪麗嚴加管教，只有隨身攜帶的小貓吧唧給予慰藉。在莊園荒廢的東側區域，瑪麗發現了一座被常春藤覆蓋的秘密花園——二十年前阿齊博爾德深愛的妻子在此意外身亡后，他便下令封閉此地。當吧唧被驅逐出屋后，瑪麗循著夜半哭聲在花園圍墻外發現隱秘入口。隨著對禁地的持續探索，她意外結識了常年臥病在床、性情暴戾的表弟柯林，以及精通園藝的農家少年迪康。三個孩子在復育花園的過程中建立起深厚羈絆，逐漸揭開這座莊園塵封二十年的悲傷往事。
