2023年?yáng)|京。東山首相（中村トオル飾）在世界環(huán)境大會(huì)上宣布推進(jìn)"COMS"系統(tǒng)，同時(shí)成立由各省優(yōu)秀青年官僚組成的"日本未來(lái)促進(jìn)委員會(huì)"。環(huán)境省職員天海啟示（小栗旬飾）與經(jīng)濟(jì)產(chǎn)業(yè)省常盤浩一（松山ケンイチ飾）入選該委員會(huì)。此時(shí)地質(zhì)學(xué)家田所雄介（香川照之飾）在周刊發(fā)表關(guān)東沉沒(méi)預(yù)警，引發(fā)社會(huì)動(dòng)蕩。天海為平息事態(tài)與田所會(huì)面卻遭冷遇，對(duì)方更預(yù)言伊豆海岸某島嶼即將沉沒(méi)并成為關(guān)東沉沒(méi)的前兆。同期，天海因疑似與環(huán)保企業(yè)"DPlans"存在利益勾結(jié)遭記者椎名實(shí)梨（杏飾）質(zhì)疑。為查證真相，天海與常盤前往伊豆海域潛水考察，在水下發(fā)現(xiàn)大規(guī)模海底裂痕及異?；鹕交顒?dòng)。與此同時(shí)，田所雄介的科學(xué)團(tuán)隊(duì)通過(guò)深海探測(cè)器"白瀨號(hào)"證實(shí)地殼異常運(yùn)動(dòng)，東山政府開始秘密啟動(dòng)應(yīng)對(duì)計(jì)劃。隨著伊豆某離島突然出現(xiàn)地基塌陷，天海逐漸意識(shí)到田所預(yù)言的真實(shí)性，并發(fā)現(xiàn)COMS系統(tǒng)與沉沒(méi)危機(jī)存在關(guān)鍵關(guān)聯(lián)。