天主教神父亞歷山大（希斯·萊杰飾）因質疑教會權威而被視為異端。其摯友離奇死亡后，警方判定為自殺案件，但尸體上的神秘烙印引發亞歷山大疑慮。他聯合警探馬拉（莎妮·索薩蒙飾）展開調查，將烙印圖像送往梵蒂岡導師多米尼克神父（弗朗切斯科·卡爾內盧蒂飾）處鑒定。隨著教會高層對調查的異常干預，亞歷山大發現該烙印與中世紀異端儀式存在關聯。在追查過程中，他相繼遭遇神秘殺手襲擊、檔案資料被銷毀等阻撓，逐漸揭露梵蒂岡內部存在的黑暗獻祭網絡。最終真相指向其導師多米尼克正是以血色彌撒操控教會的幕后黑手，而摯友因發現該秘密遭滅口。當亞歷山大在圣彼得教堂直面多米尼克時，后者啟動獻祭儀式企圖將其處決，卻因圣物反噬而自取滅亡。