佇立于近未來大都市一角的忍者宅邸。住在那里的忍者一族石動家的長女·律花，憧憬著身為研究人員的父親。她覺得平凡而幸福的生活會一直持續下去，但就在某一天，宅邸突然遭到神秘武裝組織的襲擊。面對走投無路的危機，律花果敢地挺身而出，但——。在父親遺留下的量子研究數據引導下，她意外激活了與家族血脈共鳴的遠古科技裝置。成為劈開黑暗的"黑"吧！律花覺醒為傳承千年的守護者"黑狐"，體內涌動的神秘能量與父親研發的納米科技融為一體。隨著真相逐漸揭開，襲擊者竟是覬覦石動家守護的古代能源核心"狐火之玉"。在昔日忍者同伴與人工智能助手協助下，律花必須駕馭這份力量，在都市叢林間展開穿梭古今的決戰。