故事發(fā)生在從未出現(xiàn)奧特曼與怪獸的地球。外星人"奧美迦"手持象征身份的紅色宇宙回旋鏢墜落地球，失去記憶后以人類(lèi)形態(tài)"宙人"生活。他對(duì)人類(lèi)社會(huì)充滿好奇并積極接觸，當(dāng)神秘巨型怪獸接連出現(xiàn)時(shí)，塵封記憶逐漸復(fù)蘇。面對(duì)威脅宙人的使命感驅(qū)使其變身為奧美迦奧特曼展開(kāi)戰(zhàn)斗，其紅色頭鏢成為標(biāo)志性武器。地球人類(lèi)對(duì)巨型生物與神秘戰(zhàn)士的出現(xiàn)展開(kāi)多方觀察，普通青年"優(yōu)幸"逐漸成為宙人的并肩伙伴。通過(guò)對(duì)抗怪獸的戰(zhàn)斗經(jīng)歷，兩人建立起深厚羈絆，在共同探尋真相的過(guò)程中逐步揭示奧美迦守護(hù)地球的深層原因。最終決戰(zhàn)中，隨著關(guān)鍵記憶碎片的完整拼接，奧美迦終于理解自己跨越宇宙來(lái)到此地的宿命，并以紅色頭鏢為媒介完成守護(hù)使命的身份覺(jué)醒。