一個神秘的元旦夜晚，海底巨浪將奇異生物麥克·哈克斯沖上岸。醫學界認定其死亡時，海洋學家伊莉沙白·瑪麗博士將他放歸海洋使其復活。這個擁有再生能力與特殊視力的海底來客，其來源連電腦也只能推測可能關聯亞特蘭蒂斯文明。隨著調查深入，神秘組織"黑色守衛"浮出水面——這個長期盤踞海底的邪惡勢力企圖利用麥克的力量控制海洋能源。麥克與伊莉沙白博士團隊展開合作，在對抗黑色守衛的系列行動中逐漸恢復記憶，發現自己的使命是守護人類與海洋文明間的平衡。最終麥克在完成亞特蘭蒂斯能源核心的保護任務后，選擇返回深海家園。