十二歲男孩菲利克斯意外將學校嚴厲的數學老師霍夫梅斯特變形成15厘米高的小人，這個超自然事件使學校陷入混亂并面臨關閉危機。在試圖尋找恢復老師原狀的方法過程中，菲利克斯與新結識的盟友艾拉展開秘密行動，他們發現菲利克斯母親遺留的魔法配方可能是關鍵線索。經歷將微型老師帶回家中研究、躲避校長追查、對抗覬覦魔法力量的反派角色等冒險后，菲利克斯通過勇氣測試破解了配方機制。最終在全校師生見證下完成復原儀式，霍夫梅斯特不僅恢復原貌更理解了教育真諦，菲利克斯則學會了責任與同理心，其母親留下的魔法遺產也得到妥善處置。整個事件促使師生關系發生根本性轉變，并揭示了教育體制中的人文關懷缺失問題。