故事承接第一部結尾，莫格利（海利·喬·奧斯蒙配音）在人類村莊與女孩珊迪（梅·惠特曼配音）共同生活期間，因思念叢林友伴黑熊巴洛（約翰·古德曼配音）而響應森林召喚重返自然。此時的叢林危機暗涌，老虎希瑞·坎（托尼·杰伊配音）為爭奪統治權布下陷阱，企圖驅逐莫格利并威脅其動物伙伴。在重返森林的過程中，莫格利與巴洛重聚，并借助智慧化解希瑞·坎的陰謀。通過團結叢林中的友善族群，他們共同挫敗了老虎的復仇計劃，恢復森林平衡。影片延續迪士尼動畫輕松詼諧風格，在冒險敘事中探討成長與歸屬感主題，最終莫格利選擇留在叢林，完成從人類社會到自然家園的身份認同轉變。