明朝中葉,倭寇不斷騷擾東南沿海,東瀛柳生一族輔佐德川家康之余亦要席卷中原武林。于是“東瀛霸刀”柳生(任達(dá)華飾)殺入武林、所向披靡,亦要向中原武林第一高手“天劍”獨(dú)孤無極(劉松仁飾)挑戰(zhàn)。獨(dú)孤無極正要與新婚妻子夢青絲(楊紫瓊飾)成親,卻不得不為此事拖延。他向“鬼醫(yī)”(吳孟達(dá)飾)求助,遂用劇毒將自己功力提高數(shù)倍。比武之日,獨(dú)孤無極力戰(zhàn)柳生,將其趕走,自己卻被體內(nèi)毒氣錯(cuò)亂神經(jīng),以致糊涂殺死山莊里無數(shù)友人,并氣走青絲。青絲自此男裝打扮,化名獨(dú)孤貞,殺盡天下負(fù)心人。鬼醫(yī)弟子吳通(張衛(wèi)健飾)為了逃避年紀(jì)比他大許多的未婚妻牛娃(鄭裕玲飾),成婚當(dāng)日逃走,巧遇微服出游的天香公主(張曼玉飾)和貼身侍衛(wèi)(吳君如飾),三人發(fā)生爭執(zhí),此時(shí)獨(dú)孤貞出現(xiàn)解圍。而此時(shí)鎮(zhèn)上卻在傳言夢青絲在妓院擺出迷魂陣召賢比武的香艷傳聞,驚訝的獨(dú)孤貞于是與吳通一起前去探個(gè)究竟。兩人發(fā)現(xiàn)傳聞實(shí)為柳生暗中操縱的毒計(jì),意在利用獨(dú)孤貞體內(nèi)與獨(dú)孤無極相同的血脈異能反制中原武林。鬼醫(yī)現(xiàn)身揭露真相,吳通借機(jī)以獨(dú)門解藥中和毒氣,最終父子聯(lián)手擊潰柳生陰謀。戰(zhàn)后獨(dú)孤無極自知罪孽深重,甘愿被封印于鬼醫(yī)密室以贖前愆。