抗日戰爭英雄程懷遠與農村姑娘水妹子相愛并許下婚約,解放戰爭結束后他重返插水村時發現當地正遭受血吸蟲病肆虐。程懷遠啟用醫學人才李宋唐組建血防隊,為研發新藥以身試藥險些喪命,最終三日療法成功控制疫情。隊員吳忝綺對程懷遠的敬仰引發李宋唐嫉妒,導致其沖動犯下嚴重錯誤。面對血防隊失誤造成的醫療事故和村民訴求,程懷遠為顧全大局主動承擔責任并退出血防隊。在此過程中水妹子與程懷遠堅守革命理想結為夫婦,二人繼續探索防治方案,先后創立土埋法和開渠降水位等有效措施。在血吸蟲病防治進入決勝階段時,程懷遠重返滅螺前線,最終帶領團隊徹底消除這一危害多年的疫病。