在與滅霸史詩般的戰爭結束后，地球暫時回歸和平。彼得·帕克（湯姆·霍蘭德飾）回到校園生活，與好友相處融洽并暗戀個性女孩米歇爾（贊達亞飾），但始終無法走出鋼鐵俠犧牲的陰影。前往歐洲游學途中，他試圖向米歇爾表白時遭遇元素怪獸襲擊，神秘客（杰克·吉倫哈爾飾）在神盾局顧問尼克·弗瑞（塞繆爾·杰克遜飾）引薦下擊退怪物。自認無法承擔鋼鐵俠繼承者重任的彼得將高科技裝備交予神秘客，卻不知對方實為利用全息投影制造假象的前斯塔克工業員工昆汀·貝克。隨著真相揭露，彼得在梅姨（瑪麗莎·托梅飾）和哈皮（喬恩·費儒飾）協助下重獲裝備，最終在倫敦塔橋直面神秘客的幻象陷阱并揭穿其陰謀。