勞拉（艾麗西亞·維坎德飾）的父親理查德一生致力于古墓研究，卻在她幼年時因探險失蹤。成年后拒絕繼承家族企業的勞拉偶然發現父親遺留的冒險筆記，其中記載著一座神秘島嶼的坐標。為追尋真相，她與船長陸仁（吳彥祖飾）前往東南亞海域，在邪馬臺島遭遇圣三一組織首領馬賽亞斯（沃爾頓·戈金斯飾）及其雇傭兵團。該組織為獲取島上遠古女王遺骸蘊含的神秘力量，曾迫使理查德自盡身亡。勞拉在探索中發現父親為守護古墓秘密而犧牲的真相，最終摧毀祭壇能量核心，終結圣三一組織對永生力量的覬覦，并繼承父親遺志開啟全球探險生涯。