代號47（蒂莫西·奧利芬特飾）是通過基因工程改造的克隆人殺手，隸屬于秘密組織"TheAgency"。他以頸背條形碼末兩位數字作為代號，執行各類暗殺任務。在東歐執行刺殺俄羅斯政要的任務時，47意外卷入跨國政治陰謀，遭國際刑警與俄軍的聯合圍剿。追查真相過程中，他邂逅神秘女子卡米拉（歐嘉·柯瑞蘭寇飾），這位與克隆計劃存在隱秘關聯的女性逐漸動搖了47冰冷的職業本能。隨著調查深入，他發現組織內部存在叛徒，而自己作為克隆人的起源之謎竟與跨國制藥集團的非法實驗直接相關。在卡米拉協助下，47揭露了寡頭政客企圖通過嫁禍行動徹底抹除克隆人項目的陰謀，最終在完成自我救贖的同時挫敗了針對東歐政局的顛覆計劃。