日本恐怖分子赤虎以香港為亞太區軍火走私基地，利用高科技手段挑戰特區政府權威。警官陳聰（曾志偉飾）為證明自身能力，從警校選拔Jack（謝霆鋒飾）、Match（馮德倫飾）、異型（李燦森飾）與千年蟲（葉佩雯飾）四名性格叛逆但具備特殊才能的少年，組建代號"特警新人類"的秘密行動小組。為追查軍火交易線索，四人偽裝成犯罪團伙滲入黑幫頭目杰少的組織，發現其正是赤虎指定的本地接應者。隨著臥底行動深入，特警成員逐步獲得黑幫信任的同時，卻因證據鏈指向與杰少勾結而遭到警方通緝。在雙重身份危機和多方勢力圍剿中，眾人拼死突圍并意外獲取赤虎武裝基地的核心情報。最終通過策反內部人員、破解加密數據等關鍵行動，協助警方摧毀赤虎設于海底隧道的軍火庫，成功瓦解其企圖用生化武器制造恐怖襲擊的終極陰謀。