《變蠅人2》延續(xù)前作設(shè)定，1986年電影中母親維尼卡產(chǎn)下蠅蛹后驚嚇致死，當(dāng)局科研機構(gòu)巴托工業(yè)收養(yǎng)了賽斯之子馬丁·布朗多（艾瑞克·斯托羅茲飾），由巴托工業(yè)總裁巴托先生（約翰·蓋茲飾）監(jiān)護。表面視如己出的撫養(yǎng)實則暗藏研究目的，巴托通過隱藏攝像機記錄馬丁生活，并迫使其研究賽斯遺留的時空傳送裝置。馬丁雖外表俊朗、天賦異稟且與貝斯·洛根（達芙妮·祖尼加飾）相戀，但體內(nèi)變異染色體突然覺醒。隨著驚人的生長速度與超常能力被異變?nèi)〈?，馬丁逐漸顯露出恐怖的蠅人特征，在嘗試抑制突變的過程中，最終仍難逃宿命輪回，重蹈父親化為怪物的悲劇結(jié)局。