公元2199年，地球遭受宇宙帝國(guó)加米拉斯的持續(xù)侵略。冥王星基地發(fā)射的游星炸彈使地球生態(tài)瀕臨崩潰，人類(lèi)被迫遷入地下都市茍延殘喘。在最后主力艦隊(duì)全軍覆沒(méi)之際，一艘來(lái)自外星的漂流艙被發(fā)現(xiàn)于火星表面，內(nèi)藏伊斯坎達(dá)爾文明提供的救援信息——可清除放射能污染的宇宙清潔裝置D及配套波動(dòng)引擎設(shè)計(jì)圖。地球防衛(wèi)軍將尚未完工的大和號(hào)戰(zhàn)艦改裝為搭載新型引擎的宇宙戰(zhàn)艦，背負(fù)著人類(lèi)最后希望啟程穿越14萬(wàn)8千光年的星際航路。面對(duì)加米拉斯艦隊(duì)的持續(xù)追擊，大和號(hào)突破銀河鐵路等宇宙屏障，在伊斯坎達(dá)爾星取得凈化裝置并成功返回地球。歷時(shí)265天的星際遠(yuǎn)征最終扭轉(zhuǎn)了人類(lèi)滅絕的命運(yùn)，通過(guò)裝置啟動(dòng)徹底清除了行星表面輻射污染，為地表文明重建創(chuàng)造了條件。