在被各國(guó)分割統(tǒng)治的中世紀(jì)日本神州上空，由八艘船組成的學(xué)園都市艦"武藏"航行于未來(lái)世界。各國(guó)依據(jù)記載人類命運(yùn)的"圣譜"重現(xiàn)歷史，卻因執(zhí)行偏差引發(fā)"重奏統(tǒng)合爭(zhēng)亂"。學(xué)園國(guó)家間的學(xué)生們懷揣不同信念展開(kāi)激烈抗?fàn)帲纫鉀Q各國(guó)領(lǐng)土與歷史糾葛的核心矛盾，又需通過(guò)完成圣譜劇情獲取生存許可。隨著各勢(shì)力在政治博弈與戰(zhàn)斗中的沖突升級(jí)，隱藏在圣譜執(zhí)行背后的真相逐漸浮現(xiàn)——唯有突破既定歷史框架的束縛，才能開(kāi)拓真正的人類未來(lái)。學(xué)生們?cè)谑刈o(hù)與顛覆圣譜的抉擇中，將決定世界是否延續(xù)既定歷史軌跡或迎來(lái)全新可能。