西元1999年，一顆不明的巨大「流星」墜落在地球上。之後調(diào)查證實(shí)這其實(shí)是一艘外星人的宇宙船，之後世界的某些強(qiáng)國(guó)為了將其修復(fù)並彌補(bǔ)墜落時(shí)對(duì)地球環(huán)境所造成的破壞（還得掩蓋掉這個(gè)外星船墜落的事實(shí)），而組成了統(tǒng)合政府，並由地球統(tǒng)合軍將其改造成為全長(zhǎng)1200公尺的超大型主力戰(zhàn)艦，命名為「馬克羅斯」（MACROSS）。人類歷經(jīng)統(tǒng)合派與反統(tǒng)合派國(guó)家陣營(yíng)的分裂，戰(zhàn)爭(zhēng)持續(xù)中馬克羅斯改修仍同步進(jìn)行。十年後，在舉行正式起用典禮當(dāng)天，月球軌道突然出現(xiàn)時(shí)空跳躍反應(yīng)，艦上主炮自動(dòng)發(fā)射擊中外星觀測(cè)艦。統(tǒng)合軍被迫接戰(zhàn)，馬克羅斯升空啟航轉(zhuǎn)移敵方注意。青年一條輝陰錯(cuò)陽(yáng)差駕機(jī)參戰(zhàn)，救起地球少女林明美並與艦上女軍官早賴未沙結(jié)緣，三人情感糾葛逐漸介入戰(zhàn)事。人類與天頂星人（傑特拉帝）的「第一次宇宙大戰(zhàn)」爆發(fā)，最終統(tǒng)合軍以文化理解取代武力征服，透過(guò)林明美歌聲展現(xiàn)人類文化感染力，成功瓦解敵方母艦攻勢(shì)。戰(zhàn)爭(zhēng)期間形成的三角關(guān)係與文化衝擊，成為終結(jié)宇宙大戰(zhàn)的關(guān)鍵契機(jī)。