中情局特工維勒（尚格·云頓飾）與搭檔梅爾在保護機密文件任務中遭神秘組織追殺，梅爾犧牲后維勒被捕。蘇醒時他發現自己被囚禁在CIA位于深海的核潛艇黑獄，更被誣陷為出賣國家機密的叛徒。潛艇內除拷打他的探員帕特里克外，還有其恩師愛德華、女見習生凱茜及被關押的德國特工馬可（杜夫·龍格爾飾）。維勒必須在多方勢力中辨別敵友——有人覬覦機密文件，有人只想逃離深海。最終他與馬可結盟，在揭露CIA內部叛徒真面目后，利用潛艇自毀程序攜關鍵證據脫身，以實驗證明文件曾被篡改的真相洗清罪名。