《與你一起綻放～新選組青春錄～》改編自手冢治蟲的同名漫畫，以幕末動蕩時期為背景。少年丘十郎因目睹父親被斬殺而立志復仇，通過嚴苛的入伍考核進入新選組，在訓練中結識了身世成謎、劍術高超的少年大作。兩人在磨礪中建立起深厚羈絆，丘十郎逐漸領悟劍道真諦，大作則因身份疑云陷入精神危機。隨著倒幕運動激化，新選組內部矛盾與外部壓力交織，丘十郎發現父親之死牽涉復雜政治陰謀，而大作的真實出身竟與幕府存在隱秘關聯。在戊辰戰爭的浪潮中，曾經并肩作戰的摯友被推上對立陣營，在鳥羽伏見之戰的硝煙里被迫直面宿命對決。