在第二季中，那須田步（岡田將生飾）與九鬼靜（中井貴一飾）這對特立獨行的醫護搭檔，再次投身于日本醫療改革浪潮下的危機現場。面對醫生短缺與工時限制的雙重困境，兩人接受新任務——前往曾作為地區醫療支柱的西東京綜合醫院。該院在前院長腐敗丑聞曝光后，迎來標榜"正確醫療與工作方式改革"的新任年輕院長（風間俊介飾），其推行的任務共享、勤務數字化及醫療流程可視化等激進改革，實則以削減成本為本質。隨著醫療事故頻發與醫護士氣崩盤，步與靜逐漸發現改革背后的冷酷真相：新院長以數據優化為名推行非人性化管理，將醫療行為異化為機械指標游戲。兩位主角在搶救急癥患者、維護醫護權益的過程中，與堅持"效率至上"理念的新院長展開激烈對抗，最終在揭露其瀆職行為的同時，為醫療現場保留人性溫度的火種。